Albert Katz International School for Desert Studies, som tilbyr programmer som fører til master og Ph.D. grader i ørkenstudier og hydrologi og vannteknologier. Disse tverrfaglige forskningsområdene har dukket opp som svar på mangelen på vitenskapsbaserte svar på menneskehetens presserende behov.

Det naturvitenskapelige fakultet bestreber seg hele tiden på å øke antallet og kvaliteten på sine studenter, for å kontinuerlig utvikle studieretninger for å holde tritt med samfunnets krav og opprettholde den fortreffelige undervisningen. I tillegg oppmuntrer fakultetet til samhandling med samfunnet ved å forsøke å styrke båndene til industrien og det nasjonale utdanningssystemet.

PhD i Business & Management bidrar til å øke etterspørselen etter godt trente, kompetente og kreative ledere, noe som får Ben-Gurion University til å etablere The Faculty of Management. Fakultetet består av fem avdelinger og tiltrekker seg et stort antall høyt kvalifiserte søkere. Studentvalg er konkurransedyktig, med bare en liten prosentandel av kandidatene som blir akseptert hvert år.

Fakultetet for humaniora og samfunnsvitenskap tilbyr graduate-programmer som fører til Master of Arts-graden i avdelingene for atferdsvitenskap, bibel- og antikke nær-østlige studier, hebraisk språk, hebraisk litteratur, historie og filosofi.

Ph.D. i ingeniørprogrammet som tilbys av Fakultet for ingeniørvitenskap er designet for å gi en grunnleggende tilnærming til grunnleggende ingeniørprinsipper med vekt på vitenskapelige metoder. Målet med kurs og forskningsprosjekter er å utvikle individer som er i stand til kreativt arbeid innen ingeniørvitenskap og spesialiseringsområder innen ingeniørforskning og utvikling eller undervisning.